Resistance: Fall of Manin ja Resistance 2:n tapahtumien väliin sijoittuva Resistance: Retribution vie pelaajat Länsi-Euroopan sydämeen, jossa odottaa uusi sankari: James Grayson. Entinen Britannian merijalkaväen sotilas joutui tappamaan oman veljensä chimeroiden muuntokeskuksessa, ja nyt hän on kostoretkellä. Kuultuaan chimeroiden kehittäneen Länsi-Euroopassa uuden kammottavan tavan muuntaa ihmisiä Grayson liittyy eurooppalaiseen Maquis-vastarintajoukkoon. Joukon mukana hän osallistuu Operation Overstrikeen ja sotaan, jonka tavoitteena on puhdistaa maanosa chimeroista.